Die Anlagen liegt in städtischer Lage am Rande der Universitätskliniken. Sie befindet sich seit 1877 an diesem Standort. Die Bodenverhältnisse sind heterogen, im wesentlichen Geschiebelehme auf Porphyr. Klimatisch liegt die Anlage im Mitteldeutschen Regenschattenklima des östlichen Harzvorlandes.

Mit Gründung in Jahre 1542, ist der botanische Garten der Universität Leipzig der älteste Botanische Garten Deutschlands und einer der ältesten Europas. Er wurde mehrfach im Stadtgebiet verlagert. 

Ursprünglich waren die Gehölzbestände rein pflanzensystematisch gruppiert, seit ca. 1970 sind sie sowohl pflanzengeografisch, als auch systematisch gegliedert. Seit 2005 erfolgt die Umgestaltung von Teilen der systematischen Anlage in einen Diversitätsgarten, damit einhergehend wurden in die Kultur viele selten kultivierter Gehölzarten aufgenommen. Die winterharten Vertreter werden durch subtropische und tropische Gehölzarten erweitert.